Changes between Version 33 and Version 34 of SnpCallingPipeline


Ignore:
Timestamp:
Oct 16, 2010 6:36:47 PM (12 years ago)
Author:
Morris Swertz
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified
  • SnpCallingPipeline

    v33 v34  
    2222        "indelcalls.vcf"
    2323        "chr[1-24].fasta"
    24         "flowcell_lane.1fq.gz"
    25         "flowcell_lane.2fq.gz"
     24        "flowcell_lane.1.fq.gz"
     25        "flowcell_lane.2.fq.gz"
     26        "flowcell_lane.aligned.bam"
     27        "flowcell_lane2.aligned.bam"
     28        "flowcell_lane3.aligned.bam"
     29        "sample.aligned.bam"
     30        "QC reports"
     31        "VCF"
    2632
    2733        node [shape=ellipse,color=yellow]
     
    4046                style=filled;
    4147                color=lightgrey;
    42                 node [style=filled,color=white];
    43                 "flowcell_lane.1fq.gz" -> align1 -> alignPE
     48                "flowcell_lane.1.fq.gz" -> align1 -> alignPE
    4449                "chr[1-24].fasta" -> align1
    4550                "chr[1-24].fasta" -> align2
     
    5358                style=filled;
    5459                color=lightgrey;
    55                 node [style=filled,color=white];
    5660                "flowcell_lane.aligned.bam" -> Merge -> "sample.aligned.bam" -> "IndelRealigner"-> FixMateInformation
    5761                "flowcell_lane2.aligned.bam" -> Merge